Ферменты для молекулярной биологии

Hot Start Taq ДНК-полимераза с антителами

Hot Start Taq ДНК-полимераза c антителами представляет собой смесь термостабильной Taq ДНК-полимеразы и специальных блокирующих моноклональных антител. Антитела блокируют полимеразную активность при температурах до 50°С, что позволяет избежать неспецифической ампилификации на стадиях подготовки реакции. Во время начальной стадии ПЦР (денатурации) происходит диссоциация комплекса и моноклональные антитела необратимо денатурируют, а Taq ДНК-полимераза становится функционально активной. Фермент катализирует матричный синтез ДНК путем переноса нуклеотида от дНТФ на 3’-конец ДНК. Использование Hot Start Taq ДНК-полимеразы значительно повышает специфичность и чувствительность ПЦР. В настоящее время использование Hot Start вариантов полимеразы стало де-факто стандартом для количественной ПЦР и большинства диагностических приложений. Максимальная длина амплифицированного фрагмента может достигать 5000 п.н.

Фермент выделен из штамма E.coli, несущего рекомбинантную плазмиду, содержащую рекомбинантный ген ДНК-полимеразы из Thermus aquaticus. Подходит для чувствительных приложений, таких как ПЦР из единичных клеток, создание смесей для одноступенчатой ОТ-ПЦР в реальном времени (при использовании с подходящей ревертазой).

Контроль качества: ПЦР (активность), SDS-PAGE (качество очистки фермента), тест на нуклеазную активность, тест хранения при 25°С, тест на контаминацию геномной ДНК E.сoli.

Фермент Taq ДНК-полимеразу рекомендуется хранить при -20°C. Срок годности 1 год с даты проверки.

Рекомендуемые условия реакции:

  • • Используйте 1-5 е.а. фермента на 100 мкл реакционной смеси.
  • • Конечная концентрация трифосфатов в реакционной смеси – 0.1-0.2 mM.
  • • Стадию элонгации проводить при 72°С, скорость амплификации составляет 1000-2000 п.о./мин.

Кат № Наименование Концентрация, ед./мкл Количество, ед.
HST-01 Hot Start Taq ДНК-полимераза с антителами 5 5000
HST-02 Hot Start Taq ДНК-полимераза с антителами 5 1000
HST-03 Hot Start Taq ДНК-полимераза с антителами 1 1000

Taq ДНК-полимераза

Фермент Taq ДНК-полимераза может применяться для различных вариантов ПЦР, включая ПЦР в реальном времени (Real-Time PCR) с использованием TaqMan и SYBR Green. Максимальная длина амплифицированного фрагмента может достигать 5000 п.н. Фермент катализирует матричный синтез ДНК путем переноса нуклеотида от дНТФ на 3’-конец ДНК. Фермент прекрасно походит для большого круга задач, где не требуется высокая точность и достаточно молекул матрицы.

Фермент выделен из штамма E.coli, несущего рекомбинантную плазмиду, содержащую рекомбинантный ген ДНК-полимеразы из Thermus aquaticus.

Реакционный буфер: 10x AS буфер (ASB-01) входит в состав набора или приобретается отдельно.

Контроль качества: ПЦР (активность), SDS-PAGE (качество очистки фермента), тест на нуклеазную активность, тест хранения при 25°С, тест на контаминацию геномной ДНК E.сoli.

За единицу активности рекомбинантной Taq ДНК-полимеразы принимают количество фермента, необходимое для включения 10 нмоль дНТФ в кислотонерастворимую фракцию за 30 мин при 72 °C.

Рекомендуемые условия реакции:

  • • Используйте 1-5 е.а. фермента на 100 мкл реакционной смеси.
  • • Конечная концентрация трифосфатов в реакционной смеси – 0.1-0.2 mM.
  • • Стадию элонгации проводить при 72°С, скорость амплификации составляет 1000-2000 п.о./мин.

Кат № Наименование Концентрация, ед./мкл Количество, ед.
TAQ-01 Taq ДНК-полимераза 1 1000
TAQ-02 Taq ДНК-полимераза 1 1000, 10х буфер (2 мл)
TAQ-03 Taq ДНК-полимераза 5 1000, 10х буфер (2 мл)
TAQ-04 Taq ДНК-полимераза 5 1000
TAQ-05 Taq ДНК-полимераза 5 5000, 10х буфер (10 мл)

Uracil-DNA Glycosylase

Урацил-ДНК-гликозилаза (UDG) катализирует высвобождение свободного урацила из урацилсодержащей ДНК. UDG эффективно гидролизует урацил из одноцепочечной или двухцепочечной ДНК. Фермент выделен из Е. coli и не содержит эндо и экзонуклеаз. Частично инактивируется нагреванием до 95 °C.

Концентрация 10 ед/мкл.

Одна единица активности – количество фермента, необходимое для высвобождения 60 пмоль урацила в минуту из двухцепочечной урацилсодержащей ДНК.

Области применения:

  • • Контроль кросс-контаминации смесей для ПЦР продуктами предыдущей амплификации

Кат № Наименование Концентрация, ед./мкл Количество, ед.

50301

Урацил-ДНК-гликозилаза 10 200
50302 Урацил-ДНК-гликозилаза  10 1000

ДНК-лигаза фага T4

Фермент ДНК-лигаза фага T4 предназначен для быстрого лигирования липких и тупых концов фрагментов ДНК. Фермент катализирует образование фосфодиэфирной связи между 5'-фосфатными и 3'-гидроксильными концевыми группами ДНК.

Фермент успешно применяется при клонировании ДНК, создании библиотек, лигировании линкеров, пробоподготовке для NGS (в том числе 3C, Hi-C). Фермент обладает высокой удельной активностью, может применяться для «экспресс клонирования». Пригоден для электротрансформации бактерий без очистки лигазной смеси. Фермент выделен из штамма E.coli, несущего рекомбинантную плазмиду, кодирующую ДНК-лигазу фага T4.


Кат № Наименование Количество,
ед.
Объем,
мкл

LIG-01

ДНК-лигаза фага Т4 400 000 200

Pfu ДНК-полимераза

Термостабильная Pfu ДНК-полимераза выделена из E.сoli-продуцента, несущего рекомбинантный ген полимеразы Pyrococcus furiosus. Обладает 3'-5' экзонуклеазной активностью, что значительно повышает точность синтеза ДНК по сравнению с Taq ДНК-полимеразой (более чем в 20 раз). Фермент широко применяется в различных приложениях, где требуется высокая точность синтеза ДНК. Рекомендуется для клонирования ДНК, методик с использованием мегапраймеров, амплификации фрагментов ДНК с целью последующего секвенирования. Не добавляет на 3' конец ампликона остаток аденозина, что позволяет использовать Pfu ДНК-полимеразу для достройки «липких» концов ДНК. Pfu полимераза не включает в ампликон урацил. Из-за отсутствия 5`-3`- нуклеазной активности не пригодня для количественной ПЦР с пробами типа TaqMan. Максимальная длина амплифицированного фрагмента может достигать 35000 п.н.

Контроль качества: ПЦР (активность), SDS-PAGE (качество очистки фермента), тест на нуклеазную активность, тест хранения при 25°С, тест на контаминацию геномной ДНК E.сoli.

Буфер хранения: 50 mM Трис-HCl (pH 8.2), 0.1 mM ЭДТА, 1 mM ДТТ, 100 mM KCl, 0.1% Nonidet P40, 0.1% Tween 20, 50% глицерол

Реакционный буфер: LSB буфер для фрагментов 1-5 кб, буфер для фрагментов HSB 5-35 кб

Применение:

  • • Высокоточная ПЦР
  • • Получение длинных ПЦР-фрагментов
  • • Достройка «липких» концов ДНК
  • • Получение зондов и модифицированных ДНК-конструкций

Рекомендуемые условия реакции:

  • • Используйте 1-4 ед фермента на 100 мкл реакционной смеси
  • • Конечная концентрация трифосфатов в реакционной смеси – 0.1-0.2 mM
  • • Стадию элонгации проводить при 72°С, скорость амплификации составляет ~1000 п.о./мин.

Кат № Наименование Концентрация, ед./мкл Количество, ед.
PFU-01 Pfu ДНК-полимераза 5 1000
PFU-02 Pfu ДНК-полимераза 5 5000
PFU-03 Pfu ДНК-полимераза 5 1000, 10х буфер (2 мл)
PFU-04 Pfu ДНК-полимераза 1 1000, 10х буфер (2 мл)

SM-нуклеаза Serratia marcescens

Термостабильная Pfu ДНК-полимераза выделена из E.сoli-продуцента, несущего рекомбинантный ген полимеразы Pyrococcus furiosus. Обладает 3'-5' экзонуклеазной активностью, что значительно повышает точность синтеза ДНК по сравнению с Taq ДНК-полимеразой (более чем в 20 раз). Фермент широко применяется в различных приложениях, где требуется высокая точность синтеза ДНК. Рекомендуется для клонирования ДНК, методик с использованием мегапраймеров, амплификации фрагментов ДНК с целью последующего секвенирования. Не добавляет на 3' конец ампликона остаток аденозина, что позволяет использовать Pfu ДНК-полимеразу для достройки «липких» концов ДНК. Pfu полимераза не включает в ампликон урацил. Из-за отсутствия 5`-3`- нуклеазной активности не пригодня для количественной ПЦР с пробами типа TaqMan. Максимальная длина амплифицированного фрагмента может достигать 35000 п.н.

Контроль качества: ПЦР (активность), SDS-PAGE (качество очистки фермента), тест на нуклеазную активность, тест хранения при 25°С, тест на контаминацию геномной ДНК E.сoli.

Буфер хранения: 50 mM Трис-HCl (pH 8.2), 0.1 mM ЭДТА, 1 mM ДТТ, 100 mM KCl, 0.1% Nonidet P40, 0.1% Tween 20, 50% глицерол

Реакционный буфер: LSB буфер для фрагментов 1-5 кб, буфер для фрагментов HSB 5-35 кб

Применение:

  • • Высокоточная ПЦР
  • • Получение длинных ПЦР-фрагментов
  • • Достройка «липких» концов ДНК
  • • Получение зондов и модифицированных ДНК-конструкций

Рекомендуемые условия реакции:

  • • Используйте 1-4 ед фермента на 100 мкл реакционной смеси
  • • Конечная концентрация трифосфатов в реакционной смеси – 0.1-0.2 mM
  • • Стадию элонгации проводить при 72°С, скорость амплификации составляет ~1000 п.о./мин.

Кат № Наименование Концентрация, ед./мкл Количество, ед.
BNZ-01 SM-нуклеаза 250 5 000, ≥90% (SDS-PAGE)
BNZ-02 SM-нуклеаза 250 25 000, ≥90% (SDS-PAGE)
BNZ-03 SM-нуклеаза 250 250 000, ≥90% (SDS-PAGE)
BNZ-04 SM-нуклеаза 250 100 000, ≥99%, Low Endotoxin
BNZ-05 SM-нуклеаза 250 500 000, ≥99%, Low Endotoxin
BNZ-06 SM-нуклеаза 250 5 000 000, ≥99%, Low Endotoxin

Обсуждение закрыто.